进至豫章口，包抄江陵，切断刘毅援兵的进军之路，并在江津烧毁舟船而向前挺进。
王镇恶等攻克江陵外城，刘毅固守内城，精锐士卒尚有数千人，两军一直战至太阳西斜。王镇恶将刘裕招抚城内士兵和百姓的书信送进城内，众军知道刘裕已到，无不失去斗志。
天色已暮，刘裕命王镇恶焚烧四周城门，齐力攻打，刘毅部众便纷纷逃散。刘毅从北门出城单骑而逃，自缢身亡。
刘裕随后率军攻克江陵，逐步消灭了刘毅的残余势力，吞并豫、江二州。
刘裕到江陵后，鉴于江州、荆州凋敝残破，法令残缺不全，百姓疲惫匮乏，为赋税劳役所困，难以为生。
下令减免税役，并推广到全国，同时对未作军用的州郡县的屯田、池塘、边塞之税，一律免除。对于那些原来因战争需要被征发的奴隶也一律放还。
此役后，刘裕割荆州十郡另设湘州，自己加督此州。
随后，进拜太傅、扬州牧，加赐羽葆、鼓吹及班剑二十人。
刘毅败亡后，以监太尉留府事驻守建康、多行不法之事的诸葛长民惴惴不安，深恐步刘毅后尘，故而有反叛之意。
刘裕班师返回建康，以计诱诸葛长民到东府，在二人谈笑之间，命壮士丁旿从后用杖将其击杀之后命人诛灭诸葛氏。
刘裕在消灭恒楚、卢循、南燕以后，开始出兵谯纵的西蜀，因赏识朱龄石的军事才干和丰富经验，刘裕力排众议，越级提拔朱龄石为益州刺史，命其率臧熹、蒯恩、刘钟和朱林等共领二万人伐蜀。
刘裕曾与朱龄石讨论作战策略，认为谯蜀鉴于上一次刘敬宣伐蜀是从内水攻蜀，会猜度晋军这次想出其不意，仍从内水进攻。
为免军情外泄，刘裕特别将一封密函交给朱龄石，示意到白帝时才能打开，故此大军自江陵出发后一直都不知循何道进军，谯蜀亦无从探知刘裕的图谋。
至白帝时，朱龄石公布密函：“大军一律经外水攻向成都，臧熹、朱林在中水攻取广汉，命弱兵搭乘十多艘高舰由内水兵向黄虎。”
此后朱龄石就率大军加快速度行军。
而谯蜀果如刘裕所想，设主力防备内水，命谯道福在涪城驻以重兵，依水两岸建城垒作防御。
第二天，各路进攻全部取胜，斩杀侯晖等人，于是进兵。谯纵的各地守军相继瓦解，谯纵出逃，他的尚书令马耽封仓库等待官军进城。
朱龄石进入成~都，杀死与谯纵同族的宗亲，对其余人
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